Objectif. Un bilan rétrospectif des prélèvements microbiologiques d'endoscopes a été réalisé afin d'identifier les facteurs de risque de non-conformité. Matériel et méthodes. Sur une période de trois ans, les résultats des prélèvements des endoscopes ont été recueillis et chaque non-conformité analysée. Le parc d'instruments de notre centre hospitalier comprend : huit coloscopes, sept bronchoscopes, six gastroscopes, quatre cystoscopes, trois nasogastroscopes, un urétéroscope. Résultats. La majorité (78,9 %) des 147 contrôles effectués sur la période d'étude est inférieure au niveau cible. Les prélèvements atteignant le niveau d'action représentent 21,1 % des cas (31 non-conformités concernant 18 endoscopes). Le nombre de non-conformités par instrument varie de un à six. L'âge (p = 0,085) et la marque (p = 0,874) de l'appareil ainsi que le caractère invasif d'une maintenance (p = 0,575) ne sont pas facteurs de risque de contamination. A contrario, le retour de maintenance (p = 0,007) et les bronchoscopes (p = 0,028) apparaissent en analyse multivariée comme facteurs de risque de non-conformité. Conclusion. Des mesures correctives comme un double nettoyage suivi d'une désinfection, réalisé deux fois en retour de maintenance, peuvent être proposées. Par ailleurs, un contrôle plus régulier concernant les bronchoscopes serait justifié.