L'objectif de ce travail était de sécuriser les différentes étapes du processus de désinfection automatisée des endoscopes à canaux mais aussi d'harmoniser les pratiques de pré-traitement des endoscopes et la gestion du matériel et des accessoires. Méthode. Débuté en août 2006, cette évaluation des pratiques professionnelles (EPP) a utilisé plusieurs outils : brainstorming, questionnaire d'analyse des causes, diagramme d'Ishikawa et audits de pratiques. Résultats. L'analyse des facteurs de risque a conduit le groupe de travail à mettre en place trente-deux actions d'amélioration réparties en cinq thématiques : information du patient, formation - communication - évaluation, organisation des prélèvements, organisation liée au matériel et organisation liée à l'endoscopie nomade. Le suivi est assuré par la mise en place d'indicateurs permettant de surveiller l'évolution des principaux points critiques. Conclusion. Cette étude a permis de réunir les différents professionnels de santé concernés par l'endoscopie en vue d'améliorer la qualité de prise en charge des patients, de sécuriser les pratiques des professionnels, d'améliorer les locaux et de suivre avec des indicateurs pertinents la pérennité de la démarche engagée.