En milieu hospitalier, les masques sont essentiellement utilisés pour limiter les risques de transmission aérienne inter-humaine d'agents infectieux. Le masque peut être utilisé pour éviter une contamination du champ opératoire ou pour protéger le patient placé en isolement protecteur. A l'inverse, il peut être porté pour protéger le personnel ou les visiteurs amenés à entrer en contact avec un patient porteur d'une infection transmissible par voie aérienne (isolement septique). Ainsi, selon les cas, soignants, patients ou visiteurs sont amenés à porter des masques. Les indications du port de masques sont subordonnées à la rédaction de conduites à tenir ou de protocoles spécifiques à chaque établissement de soins mais reposant sur les recommandations nationales et internationales qui seront développées ici. Dès lors que les situations nécessitant le port d'un masque sont établies, il faut préciser le degré d'efficacité souhaité qui dépend du type de masque. Les masques chirurgicaux ou de soins ou anti-projections n'ont pas les mêmes qualités de base et ont donc des indications différentes. Il faut de plus prendre en compte l'aspect économique qui n'est pas négligeable, du fait des grands volumes de consommables utilisés.